日本青年会議所の理事会は、青年会議所運動を統括・推進するための意思決定機関です。
会議の構成メンバーは、会頭、副会頭、専務理事、顧問、監事、地区担当常任理事、会務担当常任理事、ブロック会長、議長・委員長、JCI役員、JCI出向者となっており厳粛な運営によって成り立ち、日本青年会議所すべての運動が理事会から生まれています。